导　　师： 李加琪

授予学位： 博士

作　　者： (）;

机构地区： 华南农业大学

摘　　要： 初情期启动是母猪获得繁殖能力的必要条件，启动的早与迟对母猪的繁殖性能有重要影响。已有的研究表明，在下丘脑组织中DNA甲基化通过影响一些基因的转录活性，参与并调控哺乳动物的初情期启动，说明性腺轴系统的表观遗传修饰可能是调控母猪初情期启动的一种重要分子机制。本研究以初情期前（Pre-Puberty）、初情期（In-Puberty）和初情期后（Post-Puberty）的长大二元杂母猪的性腺轴组织为研究材料，通过简化DNA甲基化测序（RRBS），利用生物信息学技术手段，借助R和Perl语言及天河2号超算平台，比较不同MspI酶切片段范围的RRBS测序文库在猪参考基因组上的应用效果，选择合适的酶切片段构建简化DNA甲基化组学，分析该DNA甲基化组的生物学特征;探索性腺轴的DNA甲基化组学在Pre-Puberty、In-Puberty和Post-Puberty的变化规律及分子调控网络，根据基因间功能关系的远近，筛选候选基因，并采用RT-PCR方法检测部分候选基因的mRNA表达水平。　　本研究主要获得以下结果：　　（1）获得40-110 bp、110-220 bp和40-220 bp的MspI酶切片段范围构建猪简化DNA甲基化组的技术参数，发现110-220 bp在猪参考基因组上的应用效果最好，并选择该片段范围构建猪简化DNA甲基化组。在猪DNA甲基化组学中，DNA甲基化水平与基因的密度呈负相关，基因转录起始位点附近的CpG位点的甲基化水平与密度呈负相关，高CpG密度启动子的基因和低CpG密度启动子的基因呈现截然不同的甲基化模式。基因和CpG岛（CGI）座位上 CpG位点的甲基化水平与密度分别呈负相关。CGI座位和基因座位之间存在DNA甲基化互作，在CpG位点上这种互作在不同组织间呈现一样的模式，而在非CpG位点上呈现组织特异性模式。　　（2）在Pre-Puberty、In-Puberty和Post-Puberty时，卵巢组织的基因组DNA甲基化水平依次降低。

关 键 词： 甲基化组学 性腺轴组织 母猪 初情期启动

领　　域： []