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文献详细Journal detailed

响应稻瘟病菌侵染的水稻MicroRNA鉴定及初步功能研究

导  师: 陈志强

授予学位: 硕士

作  者: ();

机构地区: 华南农业大学

摘  要: 我国60%以上的居民以稻米为主食,是世界上最大的水稻生产和消费国。同时,水稻作为全球主要的粮食作物,其产量直接关系着世界的粮食安全。稻瘟病是水稻生产过程中最严重的病害之一,全球每年仅由稻瘟病造成的产量损失就高达11%~30%。近年来的研究发现,micro RNA通过调控靶基因参与到水稻抗病的各个通路之中,从而提高或降低水稻稻瘟病抗性。因此鉴定和研究与稻瘟病相关的micro RNA,可以加深对micro RNA在水稻响应稻瘟病菌过程中作用机理的认识,为防治稻瘟病提供一定的理论依据。本研究以高抗稻瘟病水稻材料H4及感稻瘟病品种中二软占为材料,通过Northern blot及stem-loop RT-q PCR对课题组前期经small RNA测序获得的novel micro RNA进行表达鉴定;结合生物信息学预测以及降解组测序结果初步确定了novel micro RNA的靶基因,并对其中的novel micro RNA T21、T34进行了初步功能研究,取得以下研究结果:(1)Northern blot及stem-loop RT-q PCR的结果表明,T15、T21、T22、T52等15个novel micro RNA在抗、感病材料中均有表达。接种稻瘟病菌0~72小时内,T48、T49和T50的表达量在抗、感病材料中均下调,而T15、T21及T30的表达量先上升后下降,T25、T31、T34及T42的表达量在抗、感病材料中差异明显。(2)45个novel micro RNA一共预测到了2260个靶基因,这些靶基因几乎涵盖了所有降解组测序所得的23个novel micro RNA的175个靶基因,表明基于互补配对原则的靶基因预测数据较为全面。(3)通过生物信息学分析发现T21、T34分别位于水稻第2、第12号染色体上,均属于基因间micro RNA,在序列上高度保守,与莲花、大豆、人类部分micro RNA有较高的同源性。组织特异性表达分析表明,T21主要在芽鞘、叶片中表达,而T34主要在茎、叶片、节间中表达。(4)通过构建GFP-靶基因融合表达载体结合烟草瞬时表达系统,初步确定了T2

关 键 词: 稻瘟 病菌侵染 水稻 鉴定

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