导　　师： 聂庆华

授予学位： 博士

作　　者： (）;

机构地区： 华南农业大学

摘　　要： 真核生物的基因组可以转录出大量的非编码 RNA，其中大部分为长链非编码RNA（Long noncoding RNA, lncRNA）。LncRNA不仅数量巨大，而且作用的方式也是多种多样的，其可多层次调控蛋白质编码基因的表达。家鸡不仅是一种重要的遗传学研究模式生物，也是一种重要的经济动物。目前，家鸡lncRNA的研究才刚刚萌芽，骨骼肌生长发育相关的lncRNA还有待发掘。本研究①通过对11胚龄、16胚龄、1日龄的杏花鸡腿部骨骼肌进行RNA-seq，构建差异表达lncRNA与顺、反式靶基因的互作网络（lncRNA-mRNA），鉴定出与骨骼肌生长发育相关的lncRNA;②对7周龄快大型肉鸡（隐性白羽洛克鸡）和慢速型肉鸡（杏花鸡）胸肌组织的差异表达lncRNA（DE-lncRNA）进行顺、反式作用靶基因预测，构建lncRNA与顺、反式靶基因的互作网络（lncRNA-mRNA）;③结合本课题组前期7周龄隐性白羽洛克鸡和杏花鸡胸肌组织的miRNA测序数据，对差异表达的miRNA（DE-miRNA）进行靶lncRNA和靶mRNA预测，构建 lncRNA作为竞争性内源 RNA（ ceRNA）的三者互作网络（lncRNA-miRNA-mRNA），并以lncIRS1招募miR-15家族调控IGF-1信号通路上关键基因IRS1为切入点，探究它们在鸡肌肉生长过程的调控作用。主要结果如下：　　1、通过对11胚龄、16胚龄、1日龄的杏花鸡腿部骨骼肌进行RNA-seq，鉴定出1995个新的lncRNA。对差异表达lncRNA进行靶基因预测，构建了lncRNA与其靶基因的互作网络（lncRNA-mRNA）。LncRNA-mRNA互作网络的功能与细胞发育，细胞生长和增殖，胚胎发育，机体发育，组织发育，及发育障碍相关。一些肌肉生长相关的lncRNA-靶基因关系对（ lncRNA-mRNA pair），包括 lnc00003323-TEAD4， lnc00005738-DMD，lnc00073545-DLK1，lnc00023378-FGF13，可以作为调控骨骼肌生长的重要候选因子。　　2、对7周龄隐性白羽洛克鸡和杏花鸡胸肌组织差异表达lncRNA进行

关 键 词： 鸡骨骼肌 长链非编码 靶基因预测 生长过程 调控作用

领　　域： []