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马氏珠母贝乙酰胆碱受体和IL-17基因鉴定及功能分析

导  师: 杜晓东;焦钰

授予学位: 硕士

作  者: ();

机构地区: 广东海洋大学

摘  要: 神经递质乙酰胆碱通过胆碱能免疫调节系统抑制炎症因子的释放,参与调控机体的免疫反应。本研究通过分析已发表基因组序列,对马氏珠母贝胆碱能免疫调节系统中的重要组成分子乙酰胆碱受体(Nicotinicacetylcholinereceptor,nAChR)和炎症细胞因子白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)基因进行鉴定,并采用多种生物信息学和分子生物学方法对其功能进行初步分析。主要研究结果如下:  1、乙酰胆碱受体的鉴定及比较分析:  与脊椎动物(人和斑马鱼)相比,乙酰胆碱受体基因在软体动物、环节动物以及腔肠动物中均出现大量扩张现象。相较于腹足类和头足类,nAChRs在5种双壳类(马氏珠母贝、长牡蛎、虾夷扇贝、深海偏顶蛤和菲律宾偏顶蛤)中的扩张最为明显,数量在99到217之间,在马氏珠母贝中数量最多,有217个。内含子-外显子结构分析显示,软体动物nAChRs基因中广泛存在intronless基因,马氏珠母贝nAChRs基因中有120个intronless基因。此外,在软体动物中还存在大量串联重复的nAChRs基因,在马氏珠母贝中有140个为串联重复基因。综上,软体动物中的nAChRs出现大量扩张,可能是由于逆转录转座和串联复制引起。  2、nAChRs序列变异分析:  马氏珠母贝中nAChRs基因的序列长度和结构域组合均呈现多样化,其配体结合结构域(ligand-bindingdomain,LBD)序列变异度较大。在马氏珠母贝中鉴定到27个α型nAChRs,其中有15个基因的配体结合处的关键氨基酸发生变异或缺失,在长牡蛎中也观察到同样的现象。同源建模结果显示马氏珠母贝中6个α型nAChRs基因缺失α1螺旋,5个基因β折叠缺失,其中Pm448.7、Pm10013868和Pm10016494同时缺失α1螺旋和β折叠。Pm10031648的跨膜区的M4和MX螺旋缺失。此外,15个α型nAChRs的LoopA和LoopC中的Tyr残基出现缺失或替换。例如:Pm

关 键 词: 马氏珠母贝 乙酰胆碱受体 基因 基因组 转录组

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