导 师: 易黎
授予学位: 硕士
作 者: ();
机构地区: 汕头大学
摘 要: 缺血性卒中(IschemicStroke,IS)是最常见的神经系统急性疾病并在2015年成为仅次于冠心病的第二大致死原因。由于其病死率高,治疗时间窗窄,对于潜在卒中人群的早期发现及预防变得越来越重要。本研究通过收集多个缺血性卒中mRNA和miRNA表达谱数据集,利用meta分析和生物信息学方法挖掘并探索疾病相关的信号通路和调控网络。进而筛选出具有信服力的候选靶基因和microRNA(miRNA)用于潜在卒中的早期诊断。通过对基因表达综合数据库GEO的系统检索,我们最终纳入了4个表达谱数据集进行研究,其中包含3个mRNA数据集(总共有102个人类外周血标本)和1个miRNA数据集(总共有65个人类外周血标本)。使用metaDEpackage和GEO2R工具对这4个微阵列数据集进行芯片分析,最终获得了大约221个具有显著表达差异(DifferentialExpressed,DE)的mRNAs(其中155个表达上调、66个表达下调)和74个显著表达差异的DE-miRNAs。通过进一步对上述DE-mRNAs,DE-miRNA进行功能富集、蛋白互作分析(Protein-proteinInteraction,PPI)、miRNA靶基因分析后并用Cytoscape软件进行相应可视化后。我们的研究最终确定了与缺血性卒中发病密切相关的6个核心mRNA和2个具有重要调控作用miRNAs,并阐明了系统性红斑狼疮(SLE)和非典型感染在脑卒中的内在关联,这可能有助于对缺血性卒中的精准治疗。然而,这些新型的生物标志物的作用及其潜在的分子机制还需要进一步的基础实验和进一步的临床证据来支撑。
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