导　　师： 舒琥

授予学位： 硕士

作　　者： ;

机构地区： 广州大学

摘　　要： 大刺鳅(Mastacembelus armatus)隶属合鳃目(Symbranchiformes)、刺鳅科(Mastacembelidae)、刺鳅属(Mastacembelus),是一种广泛分布在我国南部各水系的重要的经济鱼类。近年来,随着经济的迅猛发展,人为过度捕捞和生存条件恶化等原因,促使大刺鳅野生资源下降,因此,保护大刺鳅的野生资源迫在眉睫。物种的遗传多样性(genetic diversity)是其适应环境和保持演化潜力的基础,目前有关大刺鳅遗传多样性的研究较少,因此,本研究以不同水系的大刺鳅为研究对象,利用微卫星标记(microsatellite marker)和EPIC(exon-primed intron-crossing)分子标记,对大刺鳅的遗传多样性和遗传结构(genetic structure)进行研究,为其遗传资源保护和利用奠定基础。本研究的主要内容如下:1.通过PIMA(PCR isolation of microsatellite arrays)法和RAD-seq(restrictionsite associated DNA tags sequencing)法两种方法筛选了66对大刺鳅微卫星引物。每对引物经过聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳进行筛选。PIMA法开发的6对引物中有4对为多态引物,平均等位基因数NA为2.333,平均期望杂合度HE和观测杂合度HO分别为0.272和0.139,平均多态信息含量(PIC)值为0.234,有4个位点经校正后仍偏离哈迪温伯格(Hardy-Weinberg)平衡(P<0.05)。RAD-seq开发的60个位点中有30个偏离Hardy-Weinberg平衡,其中有58个位点表现出多态性,平均等位基因数为6.383,平均期望杂合度HE和观测杂合度HO分别为0.602和0.760,平均PIC值为0.537。2.利用10个微卫星分子标记对中国南部10个大刺鳅群体共283个个体进行了遗传多样性分析。结果显示10个微卫星位点在283个大刺鳅个体中共检测出253个等位基因,平均等位基因数NA为3.3～11.1,观测杂合度Ho为0.536～0.913,期望杂合度HE为0.452～0.799,PIC值为0.383～0.699。Hardy-Weinberg平衡检验结果显示有若干个位点偏离平衡(P<0.05)。分子变异分析(AMOVA)表明,遗传变异来源主要在于个体�

关 键 词： 大刺鳅 微卫星标记 简化基因组测序 分子标记 遗传多样性

领　　域： []