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文献详细Journal detailed

三种短体线虫的快速分子检测

导  师: 卓侃

授予学位: 硕士

作  者: ;

机构地区: 华南农业大学

摘  要: 短体线虫(Pratylenchus spp.)又称根腐线虫,是迁移性内寄生线虫,其寄主范围广泛,与孢囊线虫(Heterodera spp.)、根结线虫(Meloidogyne spp.)并称为三大植物病原线虫。我国南方的甘蔗和玉米等作物常受到玉米短体线虫(Pratylenchuszeae)、拟玉米短体线虫(P. parazeae)和最短尾短体线虫(P. brachyu rus)的侵染,造成严重的经济损失。此外,玉米短体线虫和拟玉米短体线虫常常复合侵染,依靠传统形态学较难区分。因此,本研究建立了快速检测这三种短体线虫的多重PCR、实时荧光定量PCR及环介导等温扩增(LAMP)体系,取得了以下结果:  1.构建了能同时检测玉米短体线虫、拟玉米短体线虫和最短尾短体线虫的多重PCR体系。该体系包含4对引物,分别是可扩增所有线虫的通用引物 D3A/D3 B,特异扩增玉米短体线虫的引物18S/Praty-R,特异扩增拟玉米短体线虫的引物PpzF/PpzR以及特异扩增最短尾短体线虫的引物PbF2/PbR1。该体系特异性高,灵敏性也较高,能够同时检测三种单条短体线虫的混合DN A样品。  2.基于 rDNA-ITS区分别设计了玉米短体线虫实时荧光定量 PCR特异性引物(qYF2/qYR2)和探针(qYP)以及拟玉米短体线虫特异性引物(qNF/qNR)和探针(qNP);同时基于mtDNA COI区设计了最短尾短体线虫特异性引物(qBF2/qBR1)和探针(qBP)。利用这些引物和探针建立了可分别检测玉米短体线虫、拟玉米短体线虫和最短尾短体线虫的实时荧光定量 PCR体系。该体系特异性高,扩增玉米短体线虫的Ct值是25.70-29.90;扩增拟玉米短体线虫的Ct值是25.35-25.67;扩增最短尾短体线虫的Ct值是22.19-22.81;灵敏性也高,可检测0.01条线虫DNA模板。  3.基于mtDNA COI区分别设计了扩增三种短体线虫的环介导等温扩增引物组:包括特异扩增玉米短体线虫外的引物对PZF3/P ZB3和内引物对PZF IP/P ZB

关 键 词: 短体线虫 分子检测 多重 实时荧光定量 环介导等温扩增

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