导　　师： 赵卫

授予学位： 硕士

作　　者： (）;

机构地区： 南方医科大学

摘　　要： 寨卡病毒(Zika virus，ZIKV)是一种通过蚊虫叮咬传播的RNA病毒，于1947年在乌干达寨卡丛林的发热恒河猴体内首次被发现，根据基因型差异，可分为非洲型和亚洲型。虽然ZIKV很早被发现，但由于患者临床症状轻微，仅表现为皮疹、发热、关节疼痛、结膜炎等，因此尚未引起全球关注。直至2015年巴西地区的暴发流行，并逐渐呈现出许多相关联的严重并发症，包括新生儿小头畸形症、格林-巴利综合征等，随后世界卫生组织将寨卡病毒感染列为全球突发公共卫生事件。因此，建立和完善寨卡病毒早期检测和病原分型系统显得尤为重要。　　本研究首先通过分析亚洲型寨卡病毒全基因组核酸序列特征，用AlleleID7.2软件设计型特异性探针和引物，建立亚洲型寨卡病毒的荧光定量PCR检测技术，构建标准曲线，通过特异性实验、敏感性实验以及重复性实验验证该方法的有效性。随后运用网络服务器及多种生物信息学分析软件，对寨卡病毒NS1蛋白B细胞表位进行系统性的生物信息学分析，运用蛋白质抗原理化性质、跨膜区及信号肽预测、二级结构、疏水性、抗原性、灵活性、表面可及性等多参数预测，筛选B细胞优势抗原表位。　　荧光定量PCR测试结果表明所设计的引物和探针特异性良好，对非洲型寨卡病毒、1-4型登革病毒、丙型肝炎病毒、基孔肯雅病毒以及流行性乙型脑炎病毒核酸检测无交叉反应;成功构建了标准曲线，其中相关系数R2=1，扩增效率Eff为102％;该方法灵敏度较高，最低病毒检测量可达3.415copies/μL;重复性实验结果显示各组Ct值变异系数均小于2％，表明所选方法稳定性和重复性良好。同时，通过多软件、多参数验证，最终从五条初筛的抗原表位多肽中确定两条最佳的B细胞抗原表位多肽，分别位于第253-266位(HNTREGYRTQMKGP)、第333-345位（MEIRPR

关 键 词： 寨卡病毒 亚洲谱系 荧光定量 检测 细胞表位 生物信息学 基因

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