导 师: 肖姗
授予学位: 硕士
作 者: ();
机构地区: 南方医科大学
摘 要: m6A甲基化修饰是真核生物的mRNA和lincRNA上最为普遍的表观修饰,在从酵母到人类的多个物种中都保守存在。m6A受甲基化酶METTL3/METTL14和去甲基化酶FTO/ALKBH5的密切调控,并能被YTH家族蛋白等识别。m6A可以调控信号转导、mRNA的翻译、降解、可变剪接和miRNA加工等多个生理过程。m6A的失调会引起干细胞多能性变化,胚胎发育异常,甚至引起癌症的发生。围绕m6A修饰的研究将为相关领域提供理论依据和重要线索。目前针对m6A的研究多在体外培养细胞中进行,对于在体的m6A,尤其是人类的不同组织的m6A研究很少。因此,我们对人类各主要组织中RNAm6A的分布和功能进行了研究。 首先,我们采集了人类胎儿的21个组织样本,涵盖了主要的八种组织类型:脑、肝、肺、肾、心、胃、胎盘和骨骼肌。通过我们改进过的全RNA免疫共沉淀方法,结合二代测序技术,得到各组织中的m6A全转录组分析结果。在各组织中一共测得了90644个m6A峰(m6Apeaks,m6As),其中超过一半的m6A峰是首次发现,这些m6A所在基因与组织发育密切相关。与已发表的大脑mRNAm6A测序结果相比,我们的全RNA m6A测序结果显示,各组织中许多m6As位于内含子和基因间区域。 接着,为了研究m6A甲基化的动态特征,我们进一步分析了m6As在人体组织中的差异。通过检查组织差异m6As的基因组分布,发现大约一半的组织差异m6As存在于内含子中,提示剪接等共转录过程可能与组织差异m6As有关。随后我们检查了组织差异m6As与宿主基因表达水平的关系,发现与组成型m6As相比,组织差异m6As的宿主基因在所有被测组织中表达水平均较低。组织差异的m6As所在基因与组织相关的发育过程等功能相关,表明m6A可能在细胞分化和器官发育中发挥作用。 最后,已发表工作中主要研究的是mRNA上的m6A,对lincRNA�