导　　师： 聂庆华

授予学位： 博士

作　　者： (）;

机构地区： 华南农业大学

摘　　要： 鸡骨骼肌胚胎期的生长发育是影响肌肉产量的主要因素，而肌肉产量直接影响着肉鸡的生产性能。骨骼肌的发育生长涉及一系列非常复杂的生物学过程，受到许多基因与非编码RNA的调控。环状RNA是近年来新发现的一类具有特殊环形结构的功能生物大分子，在众多的生物学过程和疾病中都发挥着重要的作用，然而它对家禽骨骼肌生长发育的影响目前尚未有报道。　　本研究采取11胚龄、16胚龄和1日龄的杏花鸡骨骼肌进行环状RNA测序，分析环状 RNA在鸡肌肉组织中的表达情况，筛查影响家鸡胚胎骨骼肌生长分化的关键环状RNA，并分析它们与基因或miRNA的相互作用。同时利用iTRAQ技术对鸡胚胎期的骨骼肌进行蛋白质组分析，鉴定骨骼肌胚胎期发育过程中的差异表达蛋白，并对它们进行功能网络分析。此外，我们进一步结合转录组和环状 RNA测序数据进行联合分析，构建蛋白、lncRNA和环状RNA综合互作网络，更系统地了解肌肉发育的分子调控通路。获得主要结果如下：　　1、在杏花鸡骨骼肌中共发现13377个环状RNA，其中有11064个环状RNA来源于编码基因（3589个），大多数环状RNA来自外显子序列，特别是编码区序列（n=8110）。　　2、在杏花鸡骨骼肌中表达量较高的环状RNA（BSRP>1）有3036个。比较腿肌E11、E16和P1三个不同的发育时期，发现有1470个差异表达的环状RNA，GO分析差异环状RNA的亲本基因，富集到多个肌肉相关的生物学过程。　　3、外显子环状RNA的miRNA结合位点分析发现有946个环状RNA含有一个或多个miRNA结合位点，共涉及到150个已知的miRNAs。验证发现鸡circRBFOX2.2-3和 circRBFOX2.2-4可结合 miRNA-206，促进成肌细胞增殖和抑制成肌细胞分化。鸡circSVIL.6-14结合miRNA-203，促进成肌细胞增殖和分化。　　4、对鸡E11、E16和P1期腿肌进行蛋白质组分析，鉴定出32

关 键 词： 杏花鸡 环状 骨骼肌 胚胎发育

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