导　　师： 刘昀

授予学位： 硕士

作　　者： (）;

机构地区： 深圳大学

摘　　要： 固有无序蛋白(intrinsically disordered protein,IDP)是一类在天然状态下没有稳定的二级或三级结构,但仍具有生理活性的蛋白质。在一定条件下,IDP无序部分的构象会发生变化,从而发挥分子伴侣、位点修饰、分子效应器、分子组装、解毒等多种功能,在分子调控网络中占据核心地位。研究发现,许多IDP在逆境胁迫下都具有可变剪接(Alternative Splicing,AS)现象,说明IDP的可变剪接与响应逆境胁迫的生理过程有着潜在的联系。可变剪接是真核生物调控基因表达的一种重要方式,也是产生功能多样化蛋白质的基础,在调节酶的活性、蛋白质的亚细胞定位和翻译后修饰过程中扮演重要角色。所以植物IDP通过可变剪接参与抗逆反应的机制值得深入研究。胚胎晚期富集蛋白(late embryogenesis abundant,LEA)是IDP中与植物抗逆功能密切相关的一类蛋白,可以被干旱、高温、高盐等非生物胁迫诱导表达,能够维持胁迫下蛋白的活性、抑制蛋白聚集、稳定蛋白构象及保护膜结构等。大豆PM18属于LEA3组蛋白,在NCBI数据库中存在两个转录本(PM18α和PM18β),本实验室在研究大豆胚根热稳定蛋白时意外鉴定到了PM18α和PM18β蛋白的特征肽段,从而证实了在大豆中存在着这两个转录本的蛋白产物。但是PM18基因的抗逆机制与可变剪接的关系还未见报道。本文首先对大豆PM18两个转录本进行生物信息学分析。ANCHOR、PONDR网站预测PM18α和PM18β均为固有无序蛋白,在N端和C端有极高的无序性,在差异氨基酸位置处PM18β的功能区域比PM18α更短,但PM18β靠近C端的功能区域更长;PREDICT PROTEIN、SMART软件预测PM18α在C端表现为3个较长螺旋且功能结合位点更长,而PM18β则为两个长螺旋和短的功能结合位点;BaCeILo、SignalP4.1预测两者定位于细胞核或细胞质,且均无信号肽;通过SWISS-MODEL建模发现PM18α具有三个长的螺旋结构域,而PM18β�

关 键 词： 大豆 胚胎晚期富集蛋白 基因 可变剪接 酵母双杂交

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