帮助 本站公告
您现在所在的位置:网站首页 > 知识中心 > 文献详情
文献详细Journal detailed

人肺癌细胞核磷酸化蛋白质组的数据非依赖质谱分析

导  师: 王通

授予学位: 硕士

作  者: ();

机构地区: 暨南大学

摘  要: 肺癌在中国的发病率和死亡率排名第一。磷酸化蛋白入核是大多信号转导通路的终末事件,从而,假设入核磷酸化蛋白质组可反应肺癌细胞的恶性程度。以往的研究发现,数据非依赖型(Data-independent acquisition,DIA)质谱技术具覆盖度高、重复性好和灵敏度高的特点。因此,利用该技术开展了首个肺癌细胞核磷酸化蛋白质组的DIA质谱分析。  以上皮样人肺癌H292,以及间质样A549和H1299细胞为研究对象,用TiO2亲和性富集磷酸化肽段。比较了传统稳定同位素二甲基标记和DIA两种质谱分析方法。发现二甲基标记法的蛋白质鉴定重现率只有约40%。而DIA法高达85%以上。经3次独立实验,在对DIA蛋白质组定量结果的聚类分析中,发现核磷酸化蛋白质组具细胞特异性,且A549和H1299的欧几里得距离较近,并与H292细胞分离;该趋势与差异蛋白统计分析一致。在与H292细胞相比显著上调(P<0.01)的核磷酸化蛋白质组中,约60%的蛋白质可形成一个聚类系数约为0.15以及网络中心度低于0.23的异质性网络,预示该网络中存在多个关键节点。与此一致,在上游分析中发现,A549和H1299细胞的特异性入核磷酸化信号由多个上游激酶显著调控。且该过程伴随转录因子复合体整体磷酸化水平上调现象,qPCR结果验证了该转录调控的部分靶基因可显著上调。  因此,首次报道肺癌细胞的核磷酸化蛋白质组可反应其恶性程度,这些磷酸化蛋白质可由多个上游激酶调控,暗示着肺癌在核信号水平的异质性。

关 键 词: 肺癌 磷酸化蛋白质组 数据非依赖型质谱 恶性程度

领  域: [] []

相关作者

作者 蒋庆

相关机构对象

机构 中山大学
机构 华南师范大学

相关领域作者