导　　师： 陈志雄

授予学位： 硕士

作　　者： (）;

机构地区： 华南农业大学

摘　　要： 药用野生稻（Oryza officinalis）为我国本土野生稻之一，蕴含大量优良农艺性状，是重要的水稻种质资源库。本研究通过对药用野生稻幼苗高温及盐胁迫处理下的转录组数据分析，得到的结果如下。　　对高温、高盐胁迫及对照组高通量转录组测序，共获得30.28Gb Clean Data，各样品Clean Data均达到3.08Gb以上，Q30在86.06%及以上。对转录组测序所得的7701307条 Conting拼接，共得到93339条Transcript和50233条Unigene。长度大于1000的Transcript的数有41159条占Transcript总数的44.09%。长度大于1000的Unigene数有14304条占总数的28.55%，Transcript与Unigene的N50分别为1878bp和1443bp。　　GO数据库共注释成功26139个Unigene，占Unigene总数的52.04%。其中大于300bp的Unigene个数为21979，占长度大于300bp Unigene总数的62.16%;大于1000bp的Unigene个数为11589占长度大于1000bp Unigene总数的81.19%。分子功能中注释到Unigene数量最多的两个个亚类为催化活性（catalytic activity）和结合（binding），其所占比例总和均超过总数的50%;细胞成分中注释到Unigene总数排名靠前的三个亚类是细胞组成（cell part）、细胞器（organelle）及细胞（cell），其所占比例均超过注释到该分类基因总数的10%;生物过程中成功注释数量排名前三的亚类是细胞途径（cellular process）、代谢途径（metabolic process）以及单有机体过程（single-organism process）。　　KOG数据库注释成功15180个Unigene，这5908个Unigene分别归入25功能分类之中。注释成功Unigene最多的KOG功能类为仅一般功能预测（General function prediction only），一共注释到3106个Unigene，占注释到KOG Unigene总数的20.46%;翻译后修饰，蛋白质周转，伴侣（ Posttranslational modification, protein turnover, chaperones）功能类注释到Unigene数量排名第二，共1705个，占注释到KOG Unigene总数的11.23%;注释到Unigene数排名第三为的是信

关 键 词： 药用野生稻 高温胁迫 高盐胁迫 转录组分析

领　　域： []