导　　师： 刘占国

授予学位： 硕士

作　　者： (）;

机构地区： 南方医科大学

摘　　要： 目的:　　结直肠癌发病率逐渐提高，已成为威胁人类健康的主要公共卫生问题之一。目前分期较晚的结直肠癌治疗效果仍欠佳，缺少有效早期诊断手段是导致治疗效果欠佳的主要原因之一。长链非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)发挥着调控基因表达的功能，在肿瘤的发生发展中扮演重要的角色，而与结直肠癌的发病关系仍有待深入研究。因此，本研究将利用公共数据库癌症基因图谱(The cancer genome atlas，TCGA)中的RNA序列数据(RNA-seq)，筛选结直肠癌发病相关的关键lncRNAs，并进行临床验证及细胞学研究，挖掘对结直肠癌患者具有诊断及预后判断意义的lncRNAs。　　方法:　　下载TCGA数据库中结直肠癌相关的RNA序列(RNA-seq)数据，进行lncRNA表达差异、功能、通路富集、蛋白-蛋白互相作用网络(protein-protein interaction network，PPI network)及lncRNA-mRNA共表达分析，同时分析lncRNAs差异表达对结直肠癌患者预后的影响;分析得出关键lncRNA后，利用21对临床标本进行验证，利用实时定量PCR(real time quantitative real-time PCR，RT-qPCR)验证其在肿瘤组织与癌旁正常对照组织中的表达差异;合成SiRNA构建表达质粒转染至结直肠癌细胞HCT116细胞株，Transwell及流式细胞术检测相关lncRNA的表达改变对HCT116细胞侵袭迁移能力及细胞凋亡的影响。　　结果:　　对TCGA453个结直肠癌临床样本数据进行分析，提示有119个lncRNAs存在差异性表达，lncRNA和编码基因(coding gene)存在共表达关系，对基因富集性分析发现，lncRNA参与细胞的多个生物学行为;16个lncRNAs对患者生存预后显著相关，其中3个lncRNABVES-AS1、HAND2-AS1和MAMDC2-AS1为关键lncRNA，可作为预后判断的标志物，同时与miRNA、codinggene存在紧密的调控网络;lncRNABVES-AS1和HAND2-AS1在结直肠癌组织中均为低表达，MAMDC2-AS1表达增高，选取MADC2-AS1利用RT-qPCR进行�

关 键 词： 结直肠癌 肿瘤基因图谱 生物信息学 细胞