导　　师： 陈瑶生

授予学位： 博士

作　　者： (）;

机构地区： 中山大学

摘　　要： 长白猪和蓝塘猪产肉量、生长速度明显不同,且从胚胎期肌肉发育到出生后肌肉肥大的不同阶段两者在肌纤维发育程度与表型均有很大的差异。本研究选择长白猪和蓝塘猪胚胎期35、49、63、77天与出生后2、28、90、180天等8个不同时期的背最长肌进行Solexa测序,通过比较两个猪种在肌肉发育过程中miRNA的表达差异,结合靶基因预测和转录组数据,对骨骼肌发育的机制进行研究,并筛选成肌候选miRNA进行功能验证。结果表明:1.出生前后差异miRNAs（DE-miRNAs）表达模式不同通过比较8个不同时期长白猪与蓝塘猪的miRNA表达谱,我们发现了257个miRNA,其中差异表达的miRNA（DE-miRNA）152个。主成分分析（PCA）将DE-miRNAs清晰的分为出生前后两个部分,说明出生前后miRNA表达模式存在差异。因此,我们将8个不同时期分为出生前后2组,分别命名为G1、G2。挑选G1、G2组中高丰度表达量的miRNAs进行热图分析,结果发现超过2/3的miRNA在品种间存在表达差异,在G1组,蓝塘猪的miRNA表达量明显高于长白猪,尤其是胚胎期35、49天;在G2组,长白猪的miRNA表达量要高于蓝塘猪。此外,与成肌相关的miR-1、miR-206和miR-133在G1、G2组中品种间差异明显。2.不同品种同一时期miRNAs表达模式不同在G1、G2组中每个时期分别挑选10个高丰度表达的DE-miRNAs,将其分为G1top（up）、G1top（down）、G2top（up）、G2top（down）等4个亚组进行比较,发现胚胎期35、49、63天和出生后2天高丰度DE-miRNAs的表达量在品种间存在较大差异。在G1top（up）亚组,胚胎期49天miR-378、mi R-30a、miR-148a和miR-127等品种间表达差异较大,胚胎期49、63、77天mi R-206在长白猪中表达量明显高于蓝塘猪。在G1top（down）亚组,胚胎期35、49、63天mi R-20、miR-499、miR-451和miR-335等miRNA品种间表达差异较大。在G2top（up）亚组,出生后2天miR-148a在长白猪中的表达量明显高于蓝塘�

关 键 词： 猪 肌肉发育 调控网络 表达谱

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