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文献详细Journal detailed

大型海藻龙须菜栽培生态系统微生物群落结构及功能研究

导  师: 杨宇峰

授予学位: 博士

作  者: ();

机构地区: 暨南大学

摘  要: 海洋微生物多样性高,分布广泛,既是初级生产者又是分解者,与浮游植物、浮游动物共同组成“微食物环”,在海洋生态系统物质运输与能量传递中起到承上启下作用,是参与海洋生物地球化学循环不可或缺的一环。因此,了解海洋微生物的多样性、群落结构及其功能显得尤为重要。已有的研究主要集中在自然海域微生物的群落特征,对海水养殖区尤其是大型海藻栽培区微生物群落特征所知甚少。为揭示大型海藻栽培区微生物群落结构及功能,本研究以广东省汕头市南澳岛龙须菜栽培区和相邻自然海区(对照区)为调查海域,通过采集不同季节、不同水深的样品,提取DNA并进行16S rRNA MiSeq高通量测序及功能基因芯片(GeoChip)杂交,比较了大型海藻龙须菜栽培区和对照区微生物群落差异,分析了龙须菜体表附生微生物组成及功能,旨在探讨龙须菜规模栽培对微生物群落的影响及其分子机理。所获结论对海洋环境保护和生物资源可持续利用具有重要科学意义。主要研究结果如下:1.于2014年4月,在南澳岛深澳湾龙须菜栽培区和对照区各设置3个采样点。每个采样点均采集表层水体、底层水体和沉积物,提取DNA并纯化后,进行16S rRNA基因Mi Seq测序。结果显示,18个样品共产生超过530,000条高质量序列,生成3454个OTU(Operational Taxonomic Units),分别属于28个门,74个纲,134个目,275个科,618个属。群落差异性检验(adonis)结果表明,龙须菜栽培区和对照区表层水体微生物群落结构差异不明显,但底层水体和沉积物中微生物群落结构差异显著(p<0.05)。在表层和底层水体中,拟杆菌、α-变形菌和γ-变形菌均为优势菌,其相对丰度在栽培区和对照区中有差异。沉积物中优势菌为拟杆菌、γ-变形菌和ε-变形菌。在属水平上,栽培区表层水体中Aestuariibacter,Crocinitomix,Leucothrix(亮发菌属)及Ten

关 键 词: 龙须菜 规模栽培 水体 沉积物 龙须菜体表微生物群落 高通量测序 功能基因芯片

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