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水稻种子休眠性基因qSD7-1的精细定位和转录组分析

导  师: 曾瑞珍

授予学位: 硕士

作  者: ();

机构地区: 华南农业大学

摘  要: 水稻种子休眠性与穗发芽抗性和种子的安全贮藏密切相关,同时也严重影响着水稻的产量和稻米品质。因此,研究水稻种子休眠性的遗传基础对培育适度休眠性的水稻优良品种、保障种子生产和贮藏安全均具有重要现实意义。本研究通过单片段代换系(W22S)与受体亲本“华粳籼74”(W0)杂交构建F2分离群体,并进一步发展次级单片段代换系,对水稻种子休眠性新基因qSD7-1进行精细定位和候选基因的初步研究,同时进行相关的转录组分析,获得了以下主要研究结果:  1、利用供体亲本为Khazar的单片段代换系W22S与受体亲本“华粳籼74”(W0)杂交的F2分离群体中含有目标基因的合适单株自交产生F3群体;采用分子标记辅助选择从中筛选到了8份不同代换片段长度的次级单片段代换系,利用重叠群代换作图的方法将水稻种子休眠性新基因qSD7-1定位于LCB14--LCB15-UI174--LCB5约48.9 kb的范围,该区间存在9个候选基因。  2、利用对照W0与单片段代换系W22S材料对目标区间的9个候选基因进行实时荧光定量表达实验,其中ORF1、ORF3、ORF6、ORF8和ORF9在种子发育过程中的整体表达量均较高,且在W0和W22S两个材料的发育后期中,其相对表达量差异均达到极显著水平;同时在发育后期剑叶和枝梗的定量表达实验中,ORF1、ORF3与ORF8的表达量相对较高且差异极显著,而ORF6和ORF9在剑叶与枝梗中表达量很低,因此初步推测ORF1、ORF3、ORF6、ORF8和ORF9为可能的目标候选基因,且不同候选基因在不同组织中的表达模式不一致。  3、利用对照W0与单片段代换系W22S材料对目标区间的9个候选基因进行测序,发现除ORF1和ORF6外,其余均未在两个材料间发现序列上的差异。其中与W0相比,来自单片段代换系W22S的ORF1在第1内含子317-318 bp处有两个AT碱基缺失,在第2、8和9外显子上存在�

关 键 词: 水稻 种子休眠 基因 精细定位 转录组分析

领  域: []

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