导 师: 邱前辉;崔勇
授予学位: 硕士
作 者: ;
机构地区: 南方医科大学
摘 要: 目的: 过敏性鼻炎(Allergic Rhinitis,AR)是最常见的呼吸道炎症性疾病之一,发病率有逐年上升的趋势,其发病机制尚未完全阐明,无法开发出有效的精准治疗手段。研究表明DNA水平的甲基化改变和RNA水平的基因表达异常可能参与AR的发病过程,因此可以借助高通量基因芯片等技术发现AR患者潜在的致病性基因及甲基化位点,并结合生物信息学方法和生物学手段进行分析和验证,从而为AR的发病机制研究提供新的思路和理论依据。 方法: 本研究首先选取AR患者(n=19)和非AR患者(n=11)的下鼻甲黏膜组织,通过全基因组甲基化芯片和全基因组表达谱芯片检测,分别筛选AR患者中出现的异常甲基化位点和差异性表达基因;随后通过Gene Ontology功能富集、KEGG通路富集、联合芯片(甲基化和表达谱)和文献检索等方法对筛选出的基因进行综合分析;最后选取AR患者(n=55)和非AR患者(n=40)的样本,在mRNA水平和蛋白水平对表达谱筛选的部分差异基因进行验证。 结果: 甲基化芯片发现,AR患者中出现的异常甲基化位点总共为94个;通过Gene Ontology功能富集、KEGG通路富集和联合表达谱芯片分析均未出现阳性结果,通过文献检索发现TLR6和IL-4R基因的异常甲基化位点可能与AR的发病关系较为密切。表达谱芯片发现,AR患者中出现差异性表达的基因总共为160个;Gene Ontology分析发现32条显著的功能富集,其中20条富集与纤毛结构或功能直接相关;KEGG分析发现8条显著的通路富集,其中1条与纤毛结构直接相关并富集最为显著;文献检索并结合纤毛结构和功能的特点,选取以下纤毛功能(FOXJ1)和纤毛结构相关(DNAI1、DNALI1和DNAH9)的差异性表达基因进行实时荧光定量PCR的验证后,确认了FOXJ1、DNAI1、DNALI1和DNAH9在AR患者下鼻甲黏膜中表达下降的现象;随后通过免疫荧�