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文献详细Journal detailed

基于云计算的RNA-seq转录组数据分析流程初探

作  者: (纪兆华); (王立东); (徐行健); (刘芳);

机构地区: 北京工业大学,北京100124\内蒙古师范大学,内蒙古呼和浩特010022\兴安职业技术学院,内蒙古乌兰浩特137400

出  处: 《科技创新导报》 2017年第19期159-159,161,共2页

摘  要: 随着二代测序技术的不断发展,转录组学的研究有了新的工具RNA-seq。RNA-seq可以使用高通量测序技术快速对细胞某一个状态下完整的转录组进行测序,获得该转录组中所有的RNA序列。相比与以往利用芯片和PCR等技术来研究转录组,RNA-seq有着许多明显的优势,所以其应用的规模不断增加。但是RNA-seq测序结构文件非常大,每一个转录组样品都会产生几Gb到几十Gb的序列文件,传统的RNA-seq数据分析软件需要耗费大量的时间和系统资源来完成分析任务。采用云计算的方法和框架,开发一套完整的RNA-seq转录组大数据分析软件,用户只需输入RNA-seq测序的原始序列文件,即可得到最终的结果。

关 键 词: 云计算 转录组 数据分析 流程

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