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家蚕原种与正交反交子代脂肪体的差异基因表达分析

中文会议: 第十届家(柞)蚕遗传育种及良种繁育学术研讨会论文集

会议日期: 2013-07-19

会议地点: 吉林

主办单位: 中国蚕学会

作  者: ; ; ; ; ; ; ; ;

机构地区: 苏州大学医学部基础医学与生物科学学院

出  处: 《第十届家(柞)蚕遗传育种及良种繁育学术研讨会》

摘  要:   目的:如何利用杂种优势生产出人们理想的材料是未来的研究重点,因此我们对家蚕原种与正交反交子代高温处理后的基因表达差异进行分析,试图从基因表达差异方面揭示杂种优势的机理.方法:选择生产推广品种75XIN 和7532 两个家蚕原种及其正反交F1 (正交:75XIN×7532;反交:7532×75XIN)为实验材料,1-4 龄常规桑叶饲养,4 龄起蚕饷食前分雌雄饲养,于5 龄第4 天取脂肪体为研究材料,运用数字基因表达谱(DIGITAL GENE EXPRESSION PROFILING,DGE)构建对应的8 个DGE 文库结果:1.数字表达谱(DEG)测序结果统计本实验总的参考TAGS 个数为55299 个,其中UNAMBIGUOUS REFERENCE TAGS 为54721 个,占到98.95%,而总共可以比对到14623 个基因.我们构建的8 个DGE 文库,检测到969643 个CLEAN TAG,7532♂雄、7532♀雌、75XIN♂雄、75XIN♀雌、(7532♀雌)×(75XIN♂雄)雄、(7532♀雌)×(75XIN♂雄)雌、(75XIN♀雌)×(7532♂雄)雄、(75XIN♀雌)×(7532♂雄)雌分别为:120654、113684、110608、106585、136880、123526、136537、121169.DISTINCT TAGS 分别为56200、45972、44738、42584、59658、49518、58009、45107.有6227 个TAG 比对到了家蚕公共数据库中预测的基因,还有7167 个新转录本目前只能够在家蚕染色体定位.2.杂交种表达模式分析我们对杂交种和亲本进行表达模式分析,即杂交种与原种相比其基因转录本水平的差异,这里分成15种类型(分类标准按照表1进行):表达一致型(CO-F1,CO-EXPRESSION WITH THE PARENT)、F1低亲表达型(LOW-F1,LOW-EXPRESSION OF F1)、F1超亲表达型(HIGH-F1,HIGH-EXPRESSION OF F1)、母本高表达型(HIGH-P1,HIGH-EXPRESSION OF P1)、父本高表达型(HIGH-P2,HIGH-EXPRESSION OF P2)、母本低表达型(LOW-P1,LOW-EXPRESSION OF P1)、父本低表达型(LOW-P2,LOW-EXPRESSION OF P2)、中亲表达Ⅰ型(P1F1P2,MIDDLE-EXPRESSION IN P1 AND P2)、中亲表达Ⅱ型(P2F1P1,MIDDLE-EXPRESSIONIN P2 AND P1)、F1沉默表达型(SI-F1,SILENCE OF F

关 键 词: 家蚕 杂交种 杂种优势 基因表达

领  域: [农业科学] [农业科学] [农业科学] [农业科学]

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