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文献详细Journal detailed

离散小波变换用于生物序列的相似性研究

中文会议: 第四届广东省分析化学研讨会论文集

会议日期: 2010-12-01

会议地点: 广东恩平

主办单位: 广东省分析测试协会,广州市化学化工学会,广州地区科学仪器协作共用网

作  者: ; ; ; ;

机构地区: 中山大学化学与化学工程学院

出  处: 《第四届广东省分析化学研讨会》

摘  要:   该文将生物序列转化为数字序列,通过离散小波变换实现时域到频域的转化,设定阈值分别将各频域信号转化为字符串序列,根据最大公共子序列定义序列匹配度,并将其作为相似性的测度。结合不同频域层次序列的相似度全面考察生物序列的相似性。对蛋白质序列及基因编码序列的研究表明,该方法结合了小波分析与知识发现的优点,为生物序列相似性研究开辟了新的思路。

关 键 词: 离散小波变换 生物序列 最长公共子序列 匹配度

领  域: [自动化与计算机技术] [理学] [理学]

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