中文会议： 2012年中国水产学会学术年会论文集

会议日期： 2012-11-01

会议地点： 深圳

主办单位： 中国水产学会

作　　者： ; ; ; ; ;

机构地区： 中国水产科学研究院

出　　处： 《2012年中国水产学会学术年会》

摘　　要： 　　本研究应用新一代高通量测序技术ROCHE 454对大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种进行转录组测序并建立ESTS数据库，结果得到北方亚种和佛罗里达亚种EST序列分别是468671和332322条，平均长度分别是306.5BP和304.4BP.并将得到的高质量序列进行拼接，大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种共得到CONTIG序列总数分别为42056条和35743条，平均长度分别是612.6BP和588.2BP.将大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种的数据库合并，通过与蛋白数据库KEGG的比对后，共78938条EST序列被注释，由注释所含GENE ONTOLOGY (GO)信息，对序列按照分子功能、细胞功能、生物学过程进行分类.通过对大口黑鲈合并的EST库信息进行大通量SSR和SNP位点的发掘，发现了含SSRS和SNP序列分别是25469和8547条.

关 键 词： 大口黑鲈 北方亚种 佛罗里达亚种 罗氏 测序

分 类 号： [TS2 S96]

领　　域： [轻工技术与工程] [农业科学] [农业科学]