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文献详细Journal detailed

荔枝EST-SSR分子标记开发与种质资源遗传多样性分析

中文会议: 中国园艺学会热带南亚热带果树分会第三届学术研讨会论文集

会议日期: 2010-10-29

会议地点: 南宁

主办单位: 中国园艺学会

作  者: ; ; ; ; ; ; ;

机构地区: 广东省农业科学院

出  处: 《中国园艺学会热带南亚热带果树分会第三届学术研讨会》

摘  要: 利用本研究室先期获得的荔枝果皮CDNA文库EST序列,通过SSRIT在线检索,从3391条EST序列中,发现305条含有SSR,占整个文库EST的8.99[%].利用SSR-ESTS序列共设计100对EST-SSR引物,从96份荔枝种质中选取12个品种的基因组DNA,开展核心引物筛选,共筛选出多态性较好的EST-SSR分子标记30个;全部96份资源共扩出284条带,不同引物的扩增条带在3-18条,平均9.47,其中有282条为多态性带,多态率高达99.30[%],每对引物的NEI'S基因多样度范围0.186-0.396,香农信息指数范围0.318-0.558;此外,系统聚类分析结果表明,在相似系数0.5525处,可将96份荔枝种质资源分成了8大类群,该8大类群基本与其生态类型和植物学性状特征相符.在此基础上,对荔枝的主栽品种和特殊种质进行鉴别,结果表明,该30个EST-SSR分子标记在不同品种间可产生较清晰可辨的多态性差异,为荔枝品种和种质资源鉴别和鉴定的分子指纹构建奠定了良好基础.

分 类 号: [S66 S60]

领  域: [农业科学] [农业科学] [农业科学]

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相关机构对象

机构 华南农业大学经济管理学院
机构 华南农业大学
机构 中山大学新华学院
机构 华南师范大学
机构 仲恺农业工程学院

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