中文会议: 第十二届中国科协年会论文集
会议日期: 2010-11-01
会议地点: 福州
主办单位: 中国科协
机构地区: 广东海洋大学水产学院
出 处: 《第十二届中国科协年会》
摘 要: 采用LONG-PCR扩增线粒体全基因组方法得到了四带笛鲷线粒体基因组全序列,序列的分析结果表明,四带鲷线粒体基因组序列全长16514 BP,共有13个编码蛋白质基因、22个TRNA基因、2个RRNA基因和1个D-LOOP区。在编码蛋白质基因中,除COI是以GTG作为起始密码子外,其它均是以ATG起始,ND1、COII、ND3以TAG作为终止密码子,而ND4、CYT B则以不完全的T为终止密码子,其余8个蛋白质基因的终止密码子均为TAA。四带笛鲷线粒体基因组各基因长度、位置与典型的脊椎动物相似,其编码蛋白质基因和RRNA基因与其它硬骨鱼类具有很高的同源性。基于14种笛鲷线粒体区段COI、COII和CYT B基因的全序列合并成的一个组合数据集构建系统进化树,显示四带笛鲷与孟加拉笛鲷笛鲷的亲缘关系最近。
关 键 词: 四带笛鲷 线粒体基因组 系统进化 亲缘关系 编码蛋白质基因
领 域: [自然科学总论]