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绵羊FGF5基因SNP的生物信息学分析

中文会议: 中国畜牧兽医学会信息技术分会成立大会暨首届学术研讨会论文集

会议日期: 2005-10-15

会议地点: 天津

主办单位: 中国畜牧兽医学会

作  者: ; ; ; ;

机构地区: 内蒙古农业大学

出  处: 《中国畜牧兽医学会信息技术分会成立大会暨首届学术研讨会》

摘  要: 本文根据人和小鼠成纤维细胞生长因子5(FGF5)基因的同源序列设计引物对绵羊基因组进行PCR扩增,将扩增片段进行克隆和测序,并与人和小鼠的成纤维细胞生长因子5基因序列进行同源性比较,确定扩增的片断为绵羊的FGF5基因片断.采用PCR-SSCP技术分析了FGF5基因外显子在不同绵羊品种的多态性.结果表明:FGF5基因在P1引物扩增片段中存在PCR-SSCP多态性.经克隆测序分析,位于外显子1的引物1内存在G→T突变,该突变位点使编码的氨基酸发生A→S的改变;引物2中发生了碱基序列C→T的突变,这一突变位点没有引起编码氨基酸的改变,属于无义突变.对引起编码氨基酸的P1位点进一步进行了生物信息学分析,发现由于编码序列的改变引起蛋白质二级结构的变化,但没有引起功能位点和三级结构的变化.

关 键 词: 绵羊 成纤维细胞生长因子 生物信息学

分 类 号: [S]

领  域: [农业科学]

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