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中国罗非鱼7个引进种的线粒体基因序列变异及亲缘关系分析

中文会议: 第二届中国动物学会比较内分泌学分会、发育生物学分会联合学术年会论文集

会议日期: 2005-11-08

会议地点: 杭州

主办单位: 中国动物学会

作  者: ; ; ; ;

机构地区: 中山大学生命科学学院水生经济动物研究所

出  处: 《第二届中国动物学会比较内分泌学分会、发育生物学分会联合学术年会》

摘  要: 罗非鱼(Tilapias)隶属鲈形目(Perciformes)、鲈形亚目(Percoidei)丽鱼科(Cichlidae),有非洲鲫鱼之俗称.其原产子非洲,具有生长迅速、繁殖力和抗病力强等优点,因而为联合国粮农组织(FAO)向世界所推荐,迄今养殖范围已经覆盖85个国家和地区.我国罗非鱼养殖始于20世纪50世代,近十几年中发展迅速,至2001年全国罗非鱼年产量达69万吨,占世界总产量的58%,成为世界上最大的罗非鱼生产国.目前制约罗非鱼养殖业发展的突出问题是种质混杂和退化,由于罗非鱼易种间杂交,加上引进罗非鱼时种类和地区不同,造成现有种类种质混杂不纯,种苗在生长速度、雄性率、起捕率、耐寒性、饲料转化率等养殖要素方面参差不齐,养殖效果较差.因此,开展罗非鱼种间的遗传差异分析,找到种特异性标记成为当务之急.本研究实验样品采自科研单位和罗非鱼良种场保种的7个罗非鱼引进种:奥利亚罗非鱼(Oreochromisaureus)、尼罗罗非鱼(O.niloticus)、奥尼罗非鱼(O.aureus×O.niloticus)、红罗非鱼(O.spp)、莫桑比克罗非鱼(O.mossambicus)、桑给巴罗非鱼(O.hornorum)以及莫桑比克与桑给巴罗非鱼的杂交后代(Omossambicus×O.hornorum),对其线粒体4个不同基因(D-loop、Cytb、12SrRNA、16SrRNA)的序列差异进行分析.结合生物信息学,利用DNAsp和MEGA2等生物分析软件计算多态位点、种间平均核苷酸差异数、碱基组成、转换/颠换比率以及遗传距离等遗传信息指数,并用非加权组平均法(UPGMA)、邻接法(NJ)、最小进化法(ME)和最大简约法(MP)构建系统树进行聚类分析.结果表明,差异的线粒体基因序列可以作为区分罗非鱼不同种的特异性分子标记;本研究还分析了7种罗非鱼的亲缘关系,并对不同线粒体基因在研究罗非鱼亲缘关系中的适宜性进行了探讨。

关 键 词: 罗非鱼 线粒体基因 基因序列变异 种特异性标记 亲缘关系

领  域: [农业科学]

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