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高致病性蓝耳病病毒广东分离株ORF5基因的序列分析

中文会议: 中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第七次研讨会论文集

会议日期: 2008-07-01

会议地点: 北京

主办单位: 中国畜牧兽医学会

出版方 : 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所

作  者: ; ; ; ; ; ; ;

机构地区: 华南农业大学动物科学学院

出  处: 《中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第七次研讨会》

摘  要: 从广东各发病猪场病料中分离到7株高致病性PRRSV,分别命名为GDB1~GDB7。设计一对ORF5基因的特异性引物,应用RT-PCR方法从各PRRSV病毒株中扩增出ORF5基因片段,将其分别克隆到pMD19-T载体上,通过测序分析获得正确的序列。7株PRRSVORF5基因长度为720bp,共编码201个氨基酸。用DNAStar软件对序列进行分析,同时与经典毒株VR-2332株、LV株、JXA1及周边国家、国内分离株进行核苷酸序列同源性比较,并绘制系统进化树。结果显示GDB1~GDB7与美洲型代表株VR-2332核苷酸序列同源性在87.4%~88.3%之间,推导氨基酸序列同源性在87.1%~88.6%之间;和欧洲型代表株LV相比,核苷酸序列同源性为56.1%~56.6%,推导氨基酸序列同源性为55.7%~56.2%。与最近国内江西、湖南、湖北等地分离的PRRSV相比,核苷酸序列同源性在99%~100%之间,推导氨基酸序列同源性在98.0%~100%之间。从遗传进化树上可看出,7个毒株与Henan-1、SY0608、HEB1、HUN4等毒株亲缘关系较近,与CH-1a、MLVResp、VR2332等毒株亲缘关系较远。

关 键 词: 序列分析 蓝耳病病毒 基因 毒株亲缘关系 氨基酸序列 猪疾病

分 类 号: [S]

领  域: [农业科学]

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