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小菜蛾基因组研究

中文会议: 首届“全国青年昆虫学科技工作者创新论坛”论文摘要集

会议日期: 2012-07-23

会议地点: 福建武夷山

出版方 : 广东省昆虫学会、福建省昆虫学会、华南农业大学、福建农林大学

作  者: ; (岳震); (何玮毅); (杨鑫华); (杨广); (谢苗); (詹东亮);

机构地区: 福建农林大学植物保护学院应用生态研究所

出  处: 《首届“全国青年昆虫学科技工作者创新论坛”》

摘  要: <正>新一代测序技术的问世,大大加快了各物种基因组学研究的进程。然而,由于农业害虫基因组自身高度杂合的特点,给其基因组的组装带来了巨大的挑战。我们基于Illumina测序平台,利用构建Fosmid文库和全基因组鸟枪法策略,开展小菜蛾基因组的测序、组装和注释。借助于自主研发的Rabbit组装软件,我们实现了大片段重叠序列的组装和杂合区域的排除,并最终获得了1,815条scaffold序列(N50=7

关 键 词: 小菜蛾 基因组 杂合 组装 进化

分 类 号: [S433.4]

领  域: [农业科学] [农业科学]

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相关机构对象

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