导　　师： 张细权

学科专业： I0501

授予学位： 博士

作　　者： ;

机构地区： 华南农业大学

摘　　要： 鸡的基因组和人、鼠的基因组相比较有三个显著的特征：低密度的重复系列、高密度的snp(singlenucleotidep01ymorphism)以及高重组率。作为一种重要的经济动物和模式动物，鸡单核苷酸多态性的研究特别是家鸡和原鸡单核苷酸多态性的比较研究有利于我们更深刻地了解鸡的群体遗传结构，更深刻地了解表型的多样性与dna的多样性之间的关系，更深刻地了解物种演化与分子进化的机制。本研究选取了鸡生长轴上8个功能基因(6／1,gtfrl、gttslt、ins、lep[1、tits-b、~gf2、igfbp2)，和脂肪代谢密切关联的两个功能基因(?hrsp、fabp)以及和鸡产蛋性能密切关联的两个功能基因(vip、prl)共12个基因，对原鸡和家鸡的单核苷酸多态性进行了比较研究。研究发现，红色原鸡和家鸡12个座位核苷酸多样性没有显著差别。红色原鸡12个座位的0均值为0．00849±0．0008，家鸡12个座位的θ均值为o．00804±o．0008，家鸡的o值平均降低5．3％(p=0．6603>0．05)；红色原鸡12个座位π均值为o．00789±o．0008，家鸡12个座位的π均值为o．00725±0．0007，家鸡的π均值平均降低8．1％(p=0．5282>0．05)。通过对红色原鸡和家鸡的核苷酸多样性与重组率的关系的研究发现，红色原鸡核苷酸多样性的θ估计值和π估计值与重组率的相关性均不显著(r。=0．3960，p=0．0284：rz=0．0028，p=0．8692)；而家鸡核苷酸多样性的θ估计值与重组率相关不显著(r2=0．3969，p=0．0281)，但π估计值与重组率呈现显著的正相关(r2=0．6439，p=0．0010)。笔者的结论是：这些基因座位可能绝大多数都是人工选择的位点，高重组率是其多态性得以迅速恢复的重要原因(r2=0．6439)。在所研究的12个座位中，重组率最大的达到24．19(cm／№)，最小的仅为1．19(em／mb)，说明在基因组的不同区域重组率的变异范围很大，总的趋势是小染色体的重组率要明

关 键 词： 单核苷酸多态性 群体有效 连锁不平衡 单倍型 分子进化

领　　域： [农业科学] [农业科学]