帮助 本站公告
您现在所在的位置:网站首页 > 知识中心 > 文献详情
文献详细Journal detailed

塘沽地区典型土壤细菌群落结构及多样性分析

导  师: 王保莉

学科专业: H2803

授予学位: 硕士

作  者: ;

机构地区: 西北农林科技大学

摘  要: 天津塘沽地区土壤盐渍化程度比较高,土壤为盐土。目前关于盐土土壤中细菌的群落结构和多样性的研究还鲜有报道。本试验采用PCR-RFLP方法对塘沽地区典型土壤的细菌群落结构和多样性进行研究,以期了解滨海盐土中微生物的多样性和群落结构,为塘沽区农业及生态环境可持续发展、滨海新区建设及发展过程中土地资源的合理利用提供必要的科学依据。以天津塘沽区新城镇(S1、S2、S3、S4和S5)和四道桥(S6、S7和S8)滨海盐土为供试材料,研究了农田(S1、S2、S6、S7和S8)、菜地(S3和S4)和果园(S5)等3种利用方式下土壤细菌多样性。用SDS-直接提取法提取土壤中细菌的总DNA,利用细菌通用引物27F和1492R从总DNA中扩增16S rDNA片段。通过A/T克隆技术将扩增的16S rDNA片段连接到pMD19-T载体上,并转化到E.coli JM109中,经蓝白斑筛选构建16S rDNA克隆文库。用pMD19-T载体通用引物BacBEST Primer RV-M和BacBEST Primer M13-47对克隆文库中随机挑取的克隆子进行菌落PCR。菌落PCR产物纯化后用HhaⅠ和RsaⅠ分别进行酶切。酶切产物用2%的琼脂糖凝胶电泳分离,经溴化乙锭染色后,凝胶成像系统成像。对酶切图谱进行“0-1”数据分析,然后聚类统计,计算克隆文库的多样性指数。选取有代表性的克隆子进行测序,测序结果提交NCBI经BLAST比对,得到同源序列及其种属信息。利用Mega4.0构建系统发育树。得到结果如下:(1)8种不同土壤样品分别得到的OTU数为S1(93)、S2(165)、S3(115)、S4(158)、S5(163)、S6(183)、S7(156)和S8(171)。出现一次的酶切类型,即单一克隆所占的比例均较高,单一克隆所占比例的变化为S6(169/206)>S2(147/194)>S4(141/188)>S8(149/202)>S7(132/190)>S5(137/203)>S3(91/200)>S1(69/184)。8个土壤样品只有样品S1和S3出现同一优势酶切类型,其余样品无明�

关 键 词: 细菌 滨海盐土 群落结构 多样性

领  域: [农业科学] [农业科学]

相关作者

作者 阮惠扳
作者 杨纯玲
作者 涂湘蕻
作者 林美杏
作者 廖典海

相关机构对象

机构 暨南大学
机构 广东外语外贸大学
机构 广东外语外贸大学南国商学院
机构 广州大学华软软件学院
机构 华南师范大学

相关领域作者

作者 李振义
作者 吴晨
作者 张琳
作者 丁培强
作者 吴肖林