导　　师： 单卫星

学科专业： G1010

授予学位： 硕士

作　　者： ;

机构地区： 西北农林科技大学

摘　　要： 真核生物编码的小分子非编码RNA是一类重要的转录后调控因子,包括动植物中普遍存在的microRNA,siRNA,以及在哺乳动物生殖细胞中发现的piRNA等。病原卵菌是一类形态上与真菌相似,但进化上相距甚远的真核微生物,给农业生产和生态系统造成巨大的损失和破坏。小RNA分子因其普遍存在,并且具有重要的调控功能而倍受关注,然而在卵菌中至今还未见到相关小RNA的报道。本研究采用大豆疫霉菌和寄生疫霉菌作为植物病原卵菌的模式生物,通过构建小RNA文库并对其进行高通量测序,结果分析表明:大豆疫霉和寄生疫霉小RNA分子均在25nt处有峰值分布,意味着疫霉菌中可能存在相应的核酸酶加工特定大小的小RNA分子;大豆疫霉菌小RNA分子在基因组上的分布存在着显著的差异,有明显的小RNA转录热点和非转录区域存在,为疫霉菌中小RNA分子的存在及识别提供了证据;通过对大豆疫霉菌小RNA分子分类表明,疫霉菌中存在种类极其丰富的非编码小RNA分子;通过计算机预测和Northern验证,初步确定了疫霉菌中的一些tRNA和rRNA来源的小RNA分子;传统实验克隆也表明疫霉菌中有tRNA和rRNA来源的小RNA富集;对大豆疫霉菌和寄生疫霉菌tRNA来源的小RNA分子Pso4367和Ppa10815的表达模式分析表明其均在菌丝、孢子囊和卵孢子中高表达,侵染组织次之,休止孢和萌发的休止孢表达量均很低。本研究对大豆疫霉菌和寄生疫霉菌的小RNA进行初步的鉴定和分析,探索了卵菌小RNA分子的特征及种类,并识别验证了疫霉菌若干小RNA分子候选,为研究卵菌的小RNA生物学鉴定了基础,有助于了解其在卵菌和/或植物与卵菌互作中的功能,为卵菌病害的防治提供新的途径和方法。

关 键 词： 大豆疫霉菌 寄生疫霉菌 小 高通量测序 小 克隆

分 类 号： [S435.651]

领　　域： [农业科学] [农业科学]