导 师: 罗廷荣
学科专业: I0602
授予学位: 硕士
作 者: ;
机构地区: 广西大学
摘 要: 本研究采用RT—PCR技术对来自广西不同地区共15株猪瘟病毒进行E2基因的扩增、克隆和测序,得到长度为1092 bp编码364个氨基酸残基的目的基因片段。 应用DNAStar序列分析软件对所测定的广西15株与已知序列的HCLV、Shimen毒株的相应片段进行同源性分析比较。结果显示,广西株与HCLV、Shimen株的核苷酸同源性分别为81.5%~2.8%和82.8%~84.3%,推定的氨基酸同源性分别为87.1%~88.8%和88.5%~89.9%。广西毒株之间核苷酸和推定的氨基酸同源性分别为92.3%~99.9%和94.8%~100%。HCLV与Shimen核苷酸和推定的氨基酸的同源性分别为95.9%和95.3%。说明广西毒株之间的同源性很高,而广西毒株与HCLV、Shimen之间同源性都比较低。广西的15株病毒的E2蛋白的Cys位点没变,可推测CSFV E2蛋白在抗原结构方面依然保持很高的稳定性。在具有中和特性的B、C区域内724、725、729、734和738氨基酸位点发生了变异,这些变异可能导致E2蛋白的抗原性发生改变。 把15株广西流行毒株与国内外已发表的19株CSFV相应序列进行比较,并建立了遗传进化树。该遗传树主要分为两大群和一个另类,广西株皆属于基因群Ⅱ,但我国的主要参考毒株HCLV、Shimen则属于基因群Ⅰ,说明广西流行CSFV株与HCLV、Shimen有很大差异。