导　　师： 李学伟;李华

学科专业： I0501

授予学位： 硕士

作　　者： ;

机构地区： 四川农业大学

摘　　要： 本研究主要对4品种小型猪的SLAⅡ类基因DQA的外显子2进行了PCR-RFLP酶切分型，并对包含部分第1内含子、完整第2外显子及部分第2内含子在内的约341BP的序列进行了克隆测序，目的在于获得完整外显子2便于遗传分析。 综合ECORⅠ和ALUⅠ双酶切的结果分析表明：SLA-DQA基因经ECORⅠ和ALUⅠ酶切后共出现9种PCR-RFLP组合带型，巴马小型猪中存在全部9种组合带型，其余3个猪种仅存在部分组合带型。总体来看4个猪品种BBMN组合带型出现频率最高(0.2074)，是优势组合带型，AANN出现频率最低(0.0277)。经检验：高原型和华南型猪种9种基因型频率差异均不显著(P＞0.05)。对于ABMM、AANN、ABNN、AAMN、ABMN、BBMN几个组合基因型，4个品种间差异均不显著。经适合性检验，藏猪、滇南小耳猪和巴马小型猪的SLA-DQA在ECORⅠ和ALUⅠ酶切位点上已经达到了HARDY-WEINBERG平衡状态。合作猪在ECORⅠ酶切位点也达到了HARDY-WEINBERG平衡状态，但是其在ALUⅠ酶切位点没有达到平衡状态。本试验测定了37条序列，与网上序列比较，本试验共检测到4种新的等位基因并进行了初步命名，总体平均基因多样度为0.923，总体的平均核苷酸多样度为0.03707，可见SLA-DQA基因外显子2相比DQB基因来说表现中等程度的多态性。核苷酸不配对分布曲线为多峰型及TAJIMA'D中性检验不显著说明4品种小型猪群体在过去没有经受群体扩张，群体大小保持稳定。 　　在对各等位基因进行的各种分析的基础上，利用SLA-DQA各等位基因的DNA序列，通过估算两两之间的遗传距离，基于KIMURA双参数模型，以NJ法构建了各等位基因间的关系树。用NJ法重建了SLA-DQA基因的系统发育树。

关 键 词： 小型猪 基因 群体遗传结构 分子进化 外显子

分 类 号： [S813.1 S828.89]

领　　域： [农业科学] [农业科学] [农业科学] [农业科学]