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笛鲷属5种鱼类的遗传多样性及分子标记研究

导  师: 刘楚吾

学科专业: I0801

授予学位: 硕士

作  者: ;

机构地区: 湛江海洋大学

摘  要: 本文分别运用rapd及ssr分子标记技术对画眉笛鲷、金带笛鲷、金焰笛鲷、千年笛鲷和星点笛鲷等笛鲷属5种鱼的遗传多样性及其分子标记进行了研究。 从140个rapd随机引物中筛选出扩增效果好的引物22个、从20对西大西洋笛鲷的特异性微卫星引物中筛选出扩增效果好的引物11对,分别用于5种笛鲷基因组dna的扩增。扩增结果显示: 1.rapd引物对画眉笛鲷、金带笛鲷,金焰笛鲷、千年笛鲷和星点笛鲷基因组dna的扩增产物中,平均每个引物在每个个体上产生7~8个谱带,平均多态性位点比率(p)分别为:89.30%,86.70%,92.11%,86.47%和86.00%; 两个体间平均遗传距离(d)分别为:0.3431,0.2130,0.3121, 0.1825和0.1775;平均遗传多样性指数(hi)分别为:0.1634,0.1095,0.1353, 0.1022和0.1024。和其它鱼类rapd研究结果相比较可以看出,目前这五种鱼类都具有较丰富的遗传多样性。 5个种间的遗传距离(dxy)按照由大到小的顺序排列分别为0.5032(金带笛鲷与千年笛鲷)、0.4926(金带笛鲷与星点笛鲷)、0.4408(画眉笛鲷与星点笛鲷)、0.4014(千年笛鲷与星点笛鲷)、0.4005 (画眉笛鲷与千年笛鲷)、0.3748 (金焰笛鲷与星点笛鲷)、0.3617(画眉笛鲷与金带笛鲷)、0.3426(金带笛鲷与金焰笛鲷)、0.3209(金焰笛鲷与千年笛鲷)、0.2878(画眉笛鲷与金焰笛鲷)。可见:在rapd分析中,金带笛鲷与千年笛鲷之间的亲缘关系最远,画眉笛鲷与金焰笛鲷之间亲缘关系最近。 引物opa8和opp10都能一次性鉴别5种鱼。画眉笛鲷的特征谱带为opa8-413bp,金带画眉笛鲷的特征谱带为opp10-1042bp,褐带画眉笛鲷的特征谱带为opp10-806bp,金带笛鲷的特征谱带为opa8-140bp和opp10-418bp,金焰笛鲷的特征谱带为opa8-697bp和opp10-526bp,千年笛鲷的特征谱带为opa8-361bp和opp10-449bp,星点笛鲷的特征谱带为opa8-311bp和opp10-599bp。这些谱带可作为5个种间的分子标记。 2. 在11对微卫星引物对画眉笛鲷、金带笛鲷,金焰笛鲷、千年笛鲷和星点笛鲷基因组dna的扩增产物中,有效等位基因数分别为:1.9610,3.3793,3.2957,1.7893和3.6591;群体的杂合度(h)分别为:0.332,0.462,0.593,0.367和0.676;多态信息含量(pic)分别为:0.302,0.438,0.554,0.332和0.641。可见,在5种鱼的ssr分析中,星点笛鲷的遗传多样性最为丰富。 5个种间的遗传距离(da)按照由大到小的顺序依次为:0.4167(画眉笛鲷与千年笛鲷),0.4147(金焰笛鲷与千年笛鲷),0.4022(金带笛鲷与千年笛鲷),0.3748(金焰笛鲷与星点笛鲷),0.3612(画眉笛鲷与金带笛鲷),0.3527(千年笛鲷与星点笛鲷),0.3535(金带笛鲷与星点笛鲷),0.3516(画眉笛鲷与星点笛鲷),0.3470(画眉笛鲷与金焰笛鲷), 0.2920(金带笛鲷与金焰笛鲷)。可见:在ssr分析中,画眉笛鲷和千年笛鲷间的亲缘关系最远,金带笛鲷和金焰笛鲷之间的亲缘关系最近。 微卫星引物对5种笛鲷基因组的扩增产物中,金带笛鲷的特征谱带为13 prs229-115 bp;千年笛鲷的特征谱带为4 lca43-212 bp、4 lca43-240 bp和13 prs229-288 bp;星点笛鲷的特征谱带为7lca91-118 bp和19 prs275-156bp,金带画眉笛鲷和褐带画眉笛鲷没有共同的特征谱带,但金带画眉笛鲷有一条特征谱带为7lca91-111 bp。

关 键 词: 遗传多样性 分子标记 画眉笛鲷 金带笛鲷 金焰笛鲷 千年笛鲷 星点笛鲷

分 类 号: [Q959.483]

领  域: [生物学]

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