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水稻白化突变体和云南软米的超微结构观察及相关基因的遗传分析和分子标记定位

导  师: 李仕贵

学科专业: G1010

授予学位: 博士

作  者: ;

机构地区: 四川农业大学

摘  要: 水稻叶色突变(叶绿素突变)在水稻中占有很大的比例。根据叶色的的突变表型可将叶色突变体分为白化,黄化,浅绿,白翠,绿白,黄绿和条纹等8种类型。另外根据突变是否会导致死亡,可将叶色突变体分为致死型和非致死型。在非致死型突变体中主要有花斑叶突变体,部分程度失绿突变体和受温度与发育调控的叶色突变体。本研究中所研究的材料259就是一份受温度和发育进程共同控制的叶色突变体。经观察该突变体的白化表型出现在苗期(三叶期前),平均气温低于24℃的条件下。水稻苗期低温白化突变是水稻在发育早期对低温胁迫的一种适应性。 本研究利用便携式叶绿素测量仪测定了突变体在白化时期,复绿后植株的叶绿素含量,并用同为籼稻的9311作为对照。结果发现突变体在白化时的叶绿素含量低平均含量仅为1.2(SPAD)。而当突变体恢复正常后其叶绿素含量(23.6)接近对照9311的水平(25.3)。说明突变体的突变表型不会对植株的后期生长产生太大的影响。 用透射电镜观察突变体的叶绿体在不同表型下的结构变化,9311作为对照。结果发现突变体在白化时的叶绿体不能正常发育仅有囊泡状结构。而复绿后其叶绿体的结构也将恢复正常,与9311的正常叶绿体结构一致。由此进一步从微观结构上说明在白化时期,突变体的叶绿体结构发生了改变。 通过与9311,花B,太粳588和台湾香糯等不同遗传背景的材料做正反交实验。并观察后代的表现,经观察各个组合F1代的苗期在低温情况下均表现正常,而F2代的苗期在同样的环境条件下则会发生白化苗与正常绿苗的分离,经X2检验均符合3:1的分离比例,正常绿苗对白化苗显性,符合孟德尔的单基因遗传。说明该突变体受一个隐性核基因控制,暂将该基因命名为AL-12。另外利用SSR分子标记技术将该基因定位在第8染色体上,两侧最近的SSR标记RM5068和RM3702分别距基因0.5-1.1CM和4.9CM。 根据基因定位的结果,在距目的基因两侧最近的SSR标记RM3702和RM5068之间的所有CONTIGS中寻找与突变表型(低温,白化)极其相关的CDS序列最后找到了两个候选序列:细胞色素P450推测序列(PUTATIVECYTOCHROMOSOMEP450,CYP)和冷激蛋白推测序列(PUTATIVECOLDSHOCKPROTEIN,CSP)。根据这两个序列设计了三对引物,以白化突变体和9311在二叶期的叶片总RNA逆转录产物为模板,分别进行PCR扩增。其中出现了在突变体259和对照9311间有表达差异的扩增产物,该扩增产物经测序比对发现属细胞色素P450(CYP)家族。由此推测突变体的白化表型与细胞色素P450(CYP)家族有关系。 软米是一种特异的优质稻米类型,米质优良,米饭柔软富弹性,直链淀粉含量在8-15%之间。在我国主要分布在云南德宏,宝山,临沧等地区。在系统发育上是粘稻和糯稻的中间类型。另外有关控制其直链淀粉含量的分子机制也不是很清楚,因而难以直接有效地应用其优良特性。针对上述情况,本文对软米做了以下几点研究: 1.软米在WX基因型上的分类。利用分子标记484/485和PCR-ACC对毫目吕等多个不同类型的亲本材料进行PCR扩增,结果表明毫目吕的WX基因型表现为高直链淀粉类型。但经测定毫目吕的直链淀粉含量为11.9%属低直链淀粉类型。由此推测软米除了受WX主效基因作用外,还受其他与WX非等位的基因作用。 2.软米稻米胚乳的淀粉结构。利用扫描电镜观察了毫目吕成熟种子的淀粉粒结构,通过与另外一个高直链淀粉品种G46B和低直链淀粉品种蜀恢527的淀粉结构比较,发现毫目吕的胚乳淀粉排列较致密,淀粉颗粒为多角多面体,棱角分明。而G46B的胚乳淀粉排列较松散,淀粉颗粒近圆形,外表光滑。说明低直链淀粉含量的毫目吕具有优质稻米的淀粉结构。 3.软米的遗传分析。通过软米(毫目吕)和其具有同样WX基因型的亲本G46杂交,获得F1代及F2代。利用BRUKER公司VECTOR22/N型近红外线光谱仪测定其直链淀粉含量(F1混收混测,F2按单株收混合粒进行测定),并进行遗传分析。结果发现分离群体F2的直链淀粉含量频次分布表现为明显的双峰曲线。高直链淀粉含量单株/低直链淀粉含量单株的分离比例经X2测验符合3:1。表明软米低直链淀粉含量受单个隐性核基因控制,暂将该基因命名为DU-CL。 4.软米基因的初步定位。用在毫目吕和G46B间有差异的连锁标记,分析毫目吕/G46B的F2群体中的所有隐性单株,并利用MAPMAKER3.0将控制软米低直链淀粉含量的基因定位于第11染色体远端,距离RM224为20.7CM。为分子标记辅助育种和软米的进一步研究利用奠定了基础。

关 键 词: 软米 直链淀粉含量 遗传分析 基因定位 水稻

分 类 号: [Q756 S511.01]

领  域: [生物学] [农业科学]

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