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红树植物海桑简单重复序列区间(ISSR)条件的优化
Optimal Choice for Compositions in Inter-simple Sequence Repeat (ISSR) Analysis of Mangrove Plant Sonneratia caseolaris

作  者: ; ;

机构地区: 中山大学

出  处: 《广东教育学院学报》 2004年第2期80-83,共4页

摘  要: 海桑(Sonneratiacaseolaris(L.)Engler)是海桑科一种重要的红树植物.为利用ISSR分子标记研究海桑的遗传多样性,对影响ISSR PCR的多个因素,包括Taq酶的用量、Mg2+浓度和dNTP浓度、引物浓度及其退火温度、模板DNA浓度等进行研究,确定了海桑ISSR PCR分析的最适条件:10μLPCR反应体积中,10×buffer(100mmol·L-1KCl,80mmol·L-1(NH4)2SO4,100mmol·L-1Tris HCl,pH9.0,0.5%NP 40)1μL,0.35UTaq酶,2~3.75mmol·L-1Mg2+,300μmol·L-1dNTP,0.3μmol·L-1引物,10ng模板DNA. Sonneratia caseolaris is an important mangrove species of Sonneratiaceae. In order to study the genetic diversity of S.caseolaris using ISSR molecular markers, the factors affecting ISSR-PCR, which include content of Taq DNA polymerase, Mg^(2+) concentration and dNTP concentration, primers′ concentration and their annealing temperatures, and concentration of template DNA etc. were tested. The optimal ISSR-PCR reaction conditions for S.caseolaris were determined as follows: 10×buffer(100 mmol·L^(-1) KCl, 80 mmol·L^(-1) (NH_4)_2SO_4, 100 mmol·L^(-1) Tris-HCl, pH 9.0, 0.5% NP-40)1 μL,0.35 U Taq DNA polymerase,2~3.75 mmol·L^(-1 )Mg^(2+), 300 μmol·L^(-1) dNTP, 0.3 μmol·L^(-1) primer,10 ng template DNA in total 10 μL reaction volume.

关 键 词: 红树植物 海桑 遗传多样性 简单重复序列区间扩增多态 分子标记技术

领  域: [生物学] [生物学]

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