帮助 本站公告
您现在所在的位置:网站首页 > 知识中心 > 文献详情
文献详细Journal detailed

羊毛尾线虫线粒体rrnL基因部分序列的克隆和进化分析
Cloning and sequence analysis of the partial mitochondrial rrnL gene of Trichuris ovis isolates in China

作  者: ; ; ; ; ;

机构地区: 西交利物浦大学

出  处: 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 2013年第1期69-72,共4页

摘  要: 为探明中国羊毛尾线虫(Trichuris ovis)广东分离株线粒体核糖体大亚基基因(rrnL)的部分序列(prrnL)的遗传变异情况,用prrnL序列构建其与其他毛尾线虫的进化关系;应用聚合酶链反应(PCR)扩增羊毛尾线虫虫株的prrnL,将所获得的序列用ClustalX 1.81程序进行比对,然后用PAUP 4.0 Beta 10程序MP法绘制种系发育树。结果表明:所获得的prrnL序列长度为849~850 bp,种内变异在0~0.8%;13个羊毛尾线虫分离株位于同一分支,羊毛尾线虫prrnL序列种内很保守,种间差异较大(33.4%~36.1%),可作为种间遗传变异研究的标记。 The purpose of this study was to analyze sequence variation in the partial mitochondrial ribosomal large subunit gene (prrnL) among Trichuris ovis (T. ovis) isolates from Guangdong province, China and to study the phylogenetic relationships of T. ovis with other whipworms using prrnL sequences. The prrnL sequences were amplified from individual T. ovis samples by polymerase chain reaction (PCR) method and the obtained prrnL sequences were aligned using ClustalX 1.81. Maximum parsimony (MP) tree was constructed using the software PAUP 4.0 Beta 10. The lengths of all prrnL were 849-850 bp, and differences in prrnL sequences within T. ovis were 0-0.8%. Phylogenetic analyses showed that all T. ovis isolates were clustered in the same clade. The prrnL sequences were quite conserved within whipworm species while inter-species differences (33.4%-36.1%) were obvious. Thus prrnL sequences can be used as a useful marker for the differentiation and identification of different whipworms.

关 键 词: 羊毛尾线虫 线粒体 基因 种系发育关系

领  域: [农业科学] [农业科学] [农业科学]

相关作者

作者 周万琴
作者 安德鲁·帕金
作者 闫庆生
作者 杨燕斌
作者 黄庆均

相关机构对象

机构 华南师范大学
机构 华南师范大学体育科学学院
机构 东莞理工学院体育系
机构 中山大学
机构 中山大学岭南学院

相关领域作者

作者 李振义
作者 吴晨
作者 张琳
作者 丁培强
作者 吴肖林