帮助 本站公告
您现在所在的位置:网站首页 > 知识中心 > 文献详情
文献详细Journal detailed

荠菜LEAFY同源基因的克隆与进化分析
Cloning and Evolutionary Analysis of Homologous Sequences of LEAFY Gene in Capsella bursa-pastoris(Cruciferae)

作  者: ; ; ; ;

机构地区: 中国科学院华南植物园

出  处: 《热带亚热带植物学报》 2006年第2期113-119,共7页

摘  要: LEAFY同源基因是高等植物花的分生组织分化的重要调节基因。根据已发表的LEAFY同源基因序列保守区设计引物,以荠菜(Capsellabursa-pastoris(L.)Medic.)基因组DNA序列为模板,克隆了一条长2866bp的LEAFY同源基因。序列分析表明,该基因含有3个外显子和2个内含子,外显子编码424个氨基酸组成的多肽。其单个外显子核苷酸序列与拟南芥(Arabidopsisthaliana)LEAFY基因同源性在90%以上,氨基酸序列同源性为86%,而与琴叶拟南芥(Ara-bidopsislyrata)的氨基酸序列同源性高达90%。不同植物物种的LEAFY同源氨基酸序列在C端高度保守,而N端则有较大程度的变异。3个外显子进化速率不同可能是由于所受选择压力不同所致。存在于荠菜CapLFY基因346位上的精氨酸突变可能是造成荠菜两种生态型花期不同的原因。 LEA FY is an important regulator of floral meristems genes in higher plants. To investigate its origin and evolution, a LEAFY homologs with length of 2 866 bp was cloned from Capsella bursa-pastoris genome using the conserved primers from Arabidopsis thaliana LEAFY gene. Sequence analysis indicated three exons with the length of 457 bp, 407 bp and 411 bp. These exons encoded a protein of 424 amino acids. The single exon was more than 90% homologous to A. thaliana LEA FY gene, and the amino acid homology was 86%. When compared to Arabidopsis lyrata LEAFY gene, there was 93 nucleotide substitution in the exons of C. bursa-pastoris, and 74.7% of these mutations located at the third position ofcodon, the amino acid homology reached 90%. Among the three exons, Ds/Dn ratio was 1.9, 2.3 and 6.0. Homologous comparison indicated that the C-terminal amino acids were highly conserved among different plant species while the great variation existed in N-terminal. In addition, the Arg mutation located at 346 in CapLFY gene was speculated to be one of main reasons that caused the ecotypes with different flowering time in C. bursa-pastoris.

关 键 词: 荠菜 基因 克隆 进化分析

领  域: [生物学]

相关作者

作者 闫庆生
作者 杨燕斌
作者 黄庆均
作者 周孜正
作者 康佑发

相关机构对象

机构 中山大学
机构 华南理工大学
机构 中山大学政治与公共事务管理学院
机构 中山大学管理学院
机构 华南师范大学体育科学学院

相关领域作者

作者 丁培强
作者 徐松林
作者 徐枫
作者 陈光慧
作者 孙有发